Con un recorrido que ya envidarían muchos jugadores profesionales a su edad, Juan Pablo Nieto regresa a Atlético Nacional, el volante 10 del equipo sub19 verdolaga en el 2012, tuvo que esperar casi 4 años para estrenarse con el equipo profesional.
Nieto, potente volante de ataque, partió de Nacional en el segundo semestre del 2012, con una camada de juveniles verdolagas que hacían sus primeros pinitos en la primera B con el Alianza Petrolera, pero que para sorpresa de todos, lograron conquistar el ascenso a la primera A del fútbol colombiano, Jugadores como Andrés Rentería, Dayron Asprilla, Rafael Carrascal, Juan Pablo Nieto, Cristian Palomeque, Deyby Balanta, Felipe Álvarez, entre otros, todos surgidos en el equipo sub 19 de Atlético Nacional.
De aquella excelente camada juvenil, ninguno logró debutar en la primera A con la camisa de Atlético Nacional, pasaron por otros equipos y algunos están de regreso al verde, Nieto es uno de los que regresan y que afortunadamente estará este año trabajando con el equipo profesional, a pesar de su juventud, Nieto es un jugador de mucha experiencia y con mucho roce internacional, estuvo un año en Argentina con las div menores de Racing de Avellaneda, Campeón con la selección Antioquia en el 2010 al lado de Sebastián Pérez, 3 años con Alianza Petrolera en el fpc, campeón con Alianza en el 2012 en la primera B, campeón suramericano juvenil con la selección Colombia sub 20.
Con la llegada de Nieto, Nacional recupera a tres canteranos que seguramente le aportarán mucho al campeón de Colombia, Arley Rodríguez, Felipe Aguilar y Juan Pablo Nieto ya fueron compañeros mucho tiempo en la sub 19 y en Alianza Petrolera, ahora se unen nuevamente en el equipo de sus amores, buscando consolidarse en el mejor equipo de Colombia, dura labor para estos canteranos, porque la competencia es fuerte, pero tienen el suficiente talento y personalidad, para ganarse un puesto en el verde y un lugar en el corazón del hincha.